為了獲得單一類型微生物，即純培養物，微生物學家通常采用稱作富集培養的技術。
為了富集，首先要選擇好適合對象微生物的培養基，稱為選擇性培養基。例如，當我們想分離有固氮作用的細菌時，在培養基中可以加糖，但不能用含氮的營養物。又如培養厭氧菌時要隔絕氧氣，而好氧菌則要保證通氣。此外，某些特定微生物需要特殊的營養物，例如許多致病菌必須在培養基中加入血清，有些微生物又需要特定的維生素。還有細菌、放線菌的生長繁殖一般要求偏堿（7.0～7.5），霉菌和酵母菌要求偏酸（4.5～6） ；分離放線菌時，在培養基中加入數滴10％的苯酚，可以抑制霉菌和細菌的生長；在分離酵母菌和霉菌的培養基中，添加青霉素、四環素和鏈霉素等抗生素可以抑制細菌和放線菌的生長；結晶紫可以抑制革蘭氏陽性菌，培養基中加入結晶紫后，能選擇性地培養G－ 菌；7.5％NaCl可以抑制大多數細菌，但不抑制葡萄球菌，從而選擇培養葡萄球菌；德巴利酵母屬中的許多種酵母菌和醬油中的酵母菌能耐高濃度（18％～20％）的食鹽，而其他酵母菌只能耐受3％～11％濃度的食鹽，所以，在培養基中加入15％～20％濃度的食鹽，即構成耐食鹽酵母菌的選擇性培養基。因此微生物培養基種類很多，有酵母\霉菌\青霉\曲霉培養基，細菌總數\大腸菌群\糞大腸菌群\大腸桿菌培養基，金黃色葡萄球菌檢驗系列培養基，沙門氏菌，志賀氏菌檢驗系列培養基等。
常用的細菌培養基有營養肉湯和營養瓊脂培養基；常用的放線菌培養基為高氏1號培養基；常用的酵母菌培養基有馬鈴薯蔗糖培養基和麥芽汁培養基；常用的霉菌培養基有馬鈴薯蔗糖培養基、豆芽汁葡萄糖（或蔗糖）瓊脂培養基和察氏培養基等。
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